Профилирование микроРНК (8-мерных), нацеленных на гены, связанные с развитием сахарного диабета типа 2 и гипертрофии сердца

Сахарный диабет типа 2 (СД2) и гипертрофия сердца входят в первую десятку причин смертности во всем мире. СД2 и гипертрофия сердца – тесно связанные друг с другом хронические заболевания, ведущие к таким тяжелым осложнениям, как инсульт, инфаркт миокарда, ретинопатия, нефропатия и ампутация конечностей. Стратегии, основанные на анализе микроРНК (miR), наряду с другими подходами, считаются наиболее эффективными для раннего выявления хронических заболеваний, а также могут использоваться в терапии СД2 и сердечной гипертрофии. Так, проведены клинические испытания эффективности микроРНК в терапии опухолей. МикроРНК представляют собой одноцепочечные (некодирующие) последовательности из 20–22 нуклеотидов, которые комплементарно связываются со своей мРНК-мишенью, подавляя экспрессию белка на посттранскрипционном уровне. Для проверки генов, связанных с заболеванием, и сортировки общих для двух заболеваний микроРНК, таких как miR-30-5p, 101-3p.2, 190-5р, 506-3p, 9-5p, 128-3p, 137, 96-5p, 7-5p, 107, 101-3p.1, 98-5p, 124-3p.2, 124-3p.1, 16-5p, 15-5p, 497-5p, 424-5p, 195-5p, 1271-5p, let-7-5p, используют такие биоинформатические базы данных, как OMIM, реестр тестирования генов (GTR), TargetScan и ShinyGO. С помощью этих баз данных проводят также поиск микроРНК, мишени которых найдены более чем в одном гене, связанном с заболеванием, в каждом патологическом состоянии. При гипертрофии сердца к таким микроРНК относятся miR-19-3p, 183-5p.2, 153-3p, 372-3p, 302-3p, 520-3p, 373-3p, 129-5p, 144-3p, 139-5p, а в случае СД2 – miR-27-3p, 206, 1-3p, 181-5p. Эти данные могут быть полезными при выборе микроРНК для исследовательских проектов. Однако это потребует дополнительной валидации с использованием анализа экспрессии микроРНК, применения миметиков микроРНК и анти-микроРНК, чтобы проверить их потенциал при гипертрофии сердца и СД2.