<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">I.P. Pavlov Journal of Higher Nervous Activity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">I.P. Pavlov Journal of Higher Nervous Activity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0044-4677</issn><issn publication-format="electronic">3034-5316</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">The Russian Academy of Sciences</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">652011</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.31857/S0044467723060102</article-id><article-id pub-id-type="edn">IKLQWI</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading"><subject>МЕТОДИКА</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Unknown</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">WEEGIT – software for visualization and annotation of the electrophysiological activity registration data</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>WEEGIT – приложение для визуализации и описания данных электрофизиологической активности</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Suchkov</surname><given-names>D. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сучков</surname><given-names>Д. С.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shumkova</surname><given-names>V. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Шумкова</surname><given-names>В. В.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sitdikova</surname><given-names>V. R.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ситдикова</surname><given-names>В. Р.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Silaeva</surname><given-names>V. M.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Силаева</surname><given-names>В. М.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Logashkin</surname><given-names>A. E.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Логашкин</surname><given-names>А. Е.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Mamleev</surname><given-names>A. R.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Мамлеев</surname><given-names>А. Р.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Minlebaev</surname><given-names>M. G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Минлебаев</surname><given-names>М. Г.</given-names></name></name-alternatives><email>suchkov.dmitriy.ksu@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">INSERM UMR1249, INMED, Aix-Marseille University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Средиземноморский Институт Нейробиологии, ИНСЕРМ, Университет Экс-Марсель</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Kazan Federal University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">НИЛ Новые инженерные решения современных лабораторных исследований, 
Казанский (Приволжский) Федеральный Университет</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2023-11-01" publication-format="electronic"><day>01</day><month>11</month><year>2023</year></pub-date><volume>73</volume><issue>6</issue><fpage>857</fpage><lpage>872</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-02-02"><day>02</day><month>02</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2023, D.S. Suchkov, V.V. Shumkova, V.R. Sitdikova, V.M. Silaeva, A.E. Logashkin, A.R. Mamleev, M.G. Minlebaev</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2023, D.S. Suchkov, V.V. Shumkova, V.R. Sitdikova, V.M. Silaeva, A.E. Logashkin, A.R. Mamleev, M.G. Minlebaev</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">D.S. Suchkov, V.V. Shumkova, V.R. Sitdikova, V.M. Silaeva, A.E. Logashkin, A.R. Mamleev, M.G. Minlebaev</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">D.S. Suchkov, V.V. Shumkova, V.R. Sitdikova, V.M. Silaeva, A.E. Logashkin, A.R. Mamleev, M.G. Minlebaev</copyright-holder></permissions><self-uri xlink:href="https://innoscience.ru/0044-4677/article/view/652011">https://innoscience.ru/0044-4677/article/view/652011</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Wizard for EEG Information Tabling – “WEEGIT” is a software designed for visualization and annotation of the long-lasting records of activity. Long-lasting records of raw data are used in various areas of life sciences and well represented in neuroscience. In spite of development of other techniques and approaches the electrophysiological activity registration remains the “golden standard” in neurobiological research. Therefore, we developed and verified “WEEGIT” as a powerful and convenient tool for electrophysiological recordings’ description. We combined the most important features presented in other commercial and noncommercial software in the “WEEGIT”. Presented software can operate with widely used formats of records. ”WEEGIT” allows adaptive visualizing of up to 512 channels of record in different timescale without loss of efficiency and consumption of large machine resources. Visualizing also includes optional built-in temporal-spatial analysis (density of current sources or the density of action potentials) displayed as a background image. Integration of a set of optional filtering and signal transforming procedures allows improving record visualization. “WEEGIT” has a convenient graphical user interface with opportunity of simultaneous time browsing and annotating of the records in one workspace. Annotation can be done by simple text information typing as well as an interactive placing of specialized labels and objects. Software also allows saving data in the resampled format, both for the whole record and for user-defined events. In conclusion, “WEEGIT” provides a great set of benefits for the convenient workflow for beginners and specialists in the electrophysiological area of research, including preparation of the data for further specialized analysis.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Мастер визуализации информации об электроэнцефаллограмме – “WEEGIT” – программное обеспечение, предназначенное для визуализации и описания длительных регистраций сигналов. Длительные регистрации сигналов существуют в разных областях исследований и широко представлены в нейробиологии. В настоящее время регистрация электрофизиологической активности утвердилась как “золотой стандарт” в нейробиологических исследованиях. Поэтому мы предложили и апробировали “WEEGIT” как мощный и удобный инструмент для описания электрофизиологических записей. Мы объединили в “WEEGIT” наиболее востребованные функции, представленные в других коммерческих и некоммерческих программах. Представленное программное обеспечение может работать с широко распространенными форматами записей. “WEEGIT” позволяет адаптивно визуализировать до 512 каналов записи в различных временных масштабах без потери эффективности и без потребления дополнительных машинных ресурсов. Визуализация также включает опциональный встроенный пространственно-временной анализ (плотность источников тока или плотность потенциалов действия), отображаемый в виде фонового изображения. Встроенный набор дополнительных процедур фильтрации и преобразования сигнала позволяет улучшить визуализацию записи. “WEEGIT” имеет удобный графический интерфейс пользователя с возможностью одновременного просмотра и описания записей в одном рабочем пространстве. Описание может осуществляться как простым внесением текстовой информации, так и интерактивным размещением специализированных меток и объектов. Программа также позволяет сохранять данные в формате c пониженной дискретизацией как для всей записи, так и для определенных пользователем событий. В заключение следует отметить, что “WEEGIT” предоставляет большой набор инструментов для удобной работы как для начинающих пользователей, так и для специалистов в области электрофизиологических исследований, включая подготовку данных для последующего специализированного анализа.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>electrophysiology</kwd><kwd>software</kwd><kwd>analysis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>электрофизиология</kwd><kwd>программное обеспечение</kwd><kwd>анализ</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="en">The software can be freely used for scientific and educational purposes. If used for commercial purposes, it is necessary to notify the exclusive right holder (Kazan Federal University) and the author (Dmitrii Suchkov). WEEGIT is developed in MATLAB, therefore a run-time module for MATLAB R2016a is included in the installation executable file. Installation file is designed for direct installation on Windows system without additional preparations. Link to the free installation file (current version 4.62): https://gitlab.com/lab-equipment-assemblies1/weegit-public/-/blob/main/wEEGit_full_installator.exe Link to the free update patch (current version 4.63): https://gitlab.com/lab-equipment-assemblies1/weegit-public/-/blob/main/wEEGit_update_patch.exe</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Altman Y. Findjobj – find java handles of Matlab graphic objects. MATLAB Central File Exchange 2023. https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/14317-findjobj-find-java-handles-of-matlab-graphic-objects</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Buzsaki G., Anastassiou C.A., Koch C. The origin of extracellular fields andcurrents — eeg, ecog, lfp and spikes. Nature Reviews Neuroscience 2012. 13 (6): 407–420. https://doi.org/10.1038/nrn3241</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Hazan L., Zugaro M., Buzsaki G. Klusters, neuroscope, ndmanager: A free software suite for neurophysiological data processing and visualization. Journal of Neuroscience Methods 2006. 155 (2): 207–216. https://doi.org/10.1016/j.jneumeth.2006.01.017</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Nasiotis K., Cousineau M., Tadel F., Peyrache A., Leahy R.M., Pack C.C., Baillet S. Integrated open-source software for multiscale electrophysiology. Scientific Data 2019. 6 (1): 231. https://doi.org/10.1038/s41597-019-0242-z</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Patel Y.A., George A., Dorval A.D., White J.A., Christini D.J., Butera R.J. Hard real-time closed-loop electrophysiology with the real-time experiment interface (rtxi). PLOS Computational Biology 2017. 13 (5): e1005430. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005430</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Siegle J.H., Lopez A.C., Patel Y.A., Abramov K., Ohayon S., Voigts J. Openephys: an open-source, plugin-based platform for multichannel electrophysiology. Journal of Neural Engineering 2017. 14 (4): 045003. https://doi.org/10.1088/1741-2552/aa5eea</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Tadel F., Baillet S., Mosher J.C., Pantazis D., Leahy R.M. Brainstorm: A userfriendly application for meg/eeg analysis. Computational Intelligence and Neuroscience 2011. https://doi.org/10.1155/2011/879716</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
