Science and Innovations in MedicineScience and Innovations in MedicineНаука и инновации в медицине2500-13882618-754XFSBEI of Higher Education SamSMU of Ministry of Health of the Russian Federation4374410.35693/2500-1388-2019-4-3-19-24Infectious diseasesИнфекционные болезниResearch ArticleNew causative agents of respiratory tract diseases in immunocompromized patients (a review)Новые возбудители заболеваний респираторного тракта у иммунокомпрометированных пациентов (обзор литературы)https://orcid.org/0000-0002-4283-907XIsmatullinDanir D.ИсматуллинД. Д.
Russian Federation

teaching assistant of the Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

ассистент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-4806-050XZolotovMaksim O.ЗолотовМаксим Олегович
Russian Federation

postgraduate student of the Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

очный аспирант кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-5905-1895LyaminArtem V.ЛяминА. В.
Russian Federation

PhD, Associate Professor, Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

к.м.н., доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-7424-1796NikitinaTatyana R.НикитинаТ. Р.
Russian Federation

PhD, Associate Professor, Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

к.м.н., доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-0931-2038ZheleznovaElena A.ЖелезноваЕ. А.
Russian Federation

PhD, Associate Professor, Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

к.м.н., доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-3960-830XZhestkovAleksandr V.ЖестковА. В.
Russian Federation

PhD, Professor, Head of the Department of general and clinical microbiology, immunology and allergology

д.м.н., профессор, заведующий кафедрой общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии

m.o.zolotov@gmail.comSamara State Medical UniversityФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России1509201943VOL 4, NO3 (2019)ТОМ 4, №3 (2019)192408092020Copyright ©; 2019, Ismatullin D.D., Zolotov M.O., Lyamin A.V., Nikitina T.R., Zheleznova E.A., Zhestkov A.V.Copyright ©; 2019, Исматуллин Д.Д., Золотов М.О., Лямин А.В., Никитина Т.Р., Железнова Е.А., Жестков А.В.2019Ismatullin D.D., Zolotov M.O., Lyamin A.V., Nikitina T.R., Zheleznova E.A., Zhestkov A.V.Исматуллин Д.Д., Золотов М.О., Лямин А.В., Никитина Т.Р., Железнова Е.А., Жестков А.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://innoscience.ru/2500-1388/article/view/43744

The diseases of the respiratory system occupy one of the leading positions in the range of morbidities among the Russian population, both in adults and children. Partly, it is due to an increase of patients with primary and secondary immunodeficiencies, with anatomical anomalies of the respiratory tract, and other diseases of the bronchopulmonary system.

Classical pathogens, causing the bacterial respiratory diseases, as a rule, are: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas spp., Staphylococcus spp., as well as other representatives of the Enterobacteriacae family. But each year, the scientific literature presents more and more microorganisms – pathogens of infectious diseases of various localization in humans, the clinical significance of which has long remained poorly understood. These pathogens include representatives of large families of Corynebacteriaceae, Mycobacteriaceae, Nocardiaceae.

Clinical physicians need to consider possible disorders in the immune system in patients with respiratory impairment, as well as a wide range of pathogens affecting the respiratory tract. To manage such patients effectively, the close interaction of pulmonologists, bacteriologists, and allergologists-immunologists is important.

Поражение органов дыхания занимает одну из лидирующих позиций в структуре всех заболеваний взрослого и детского населения нашей страны. Отчасти это связано с увеличением количества пациентов с первичными и вторичными иммунодефицитами, больных с анатомическими аномалиями дыхательных путей и другими заболеваниями бронхолегочной системы.

Классическими возбудителями, вызывающими болезни органов дыхания бактериальной природы, как правило, являются: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas spp., Staphylococcus spp., а также другие представители семейства Enterobacteriacae. Но с каждым годом в научной литературе описывается все больше микроорганизмов – возбудителей инфекционных заболеваний различной локализации у человека, клиническое значение которых долгое время оставалось малоизученным. К таким патогенам относят представителей крупных семейств Corynebacteriaceae, Mycobacteriaceae, Nocardiaceae.

Клиницистам необходимо учитывать возможные нарушения в функционировании иммунной системы у пациентов с поражением органов дыхания, а также широкий спектр возбудителей, поражающих респираторный тракт. Для успешного ведения таких больных важно тесное взаимодействие врачей-пульмонологов, бактериологов и аллергологов-иммунологов.

immunodeficiency diseaseNocardiaGrodoniaTsukamurellaRhodococcusиммунодефицитные состоянияNocardiaGrodoniaTsukamurellaRhodococcusZhestkov AV, Protasov AD, Kozlova OS, et al. Infectiology. Fundamentals of immunodiagnostics and immunoprophylaxis of infectious diseases. Samara, 2019. (In Russ.) [Жестков А.В., Протасов А.Д., Козлова О.С. и др. Учение об инфекции. Основы иммунодиагностики и иммунопрофилактики инфекционных заболеваний. Самара, 2019].Luss LV, Martynov-Radushinskiy AA. Secondary immune deficiency. Do we always need immunomodulators? Meditsinskiy sovet. 2014;(2):40–45. (In Russ.) [Лусс Л.В., Мартынов-Радушинский А.А. Вторичная иммунная недостаточность. Всегда ли нужны иммуномодуляторы? Медицинский совет. 2014;(2):40–45].Khaitov RM. Immunology. M.: GEOTAR-Media, 2011. (In Russ.) [Хаитов Р.М. Иммунология. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011].Khaitov RM ed. Immunology and allergology. Diagnosis and treatment algorithms. M.: GEOTAR-Media, 2003. (In Russ.) [Иммунопатология и аллергология. Алгоритмы диагностики и лечения. Под ред. Хаитова Р.М. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2003].Vorob'yova AA, Bykova AS, Karaulova AV. Immunology and allergology. M., Prakticheskaya meditsina, 2006. (In Russ.) [Иммунология и аллергология. Под ред. Воробьёва А.А., Быкова А.С., Караулова А.В. М.: Практическая медицина, 2006].Luss LV, Martynov-Radushinsky AA. Role and place of immunomodulating therapy inflammatory diseases occurring against the background of secondary immune deficiency. Meditsinskiy sovet. 2013;(11):78–81. (In Russ.) [Лусс Л.В., Мартынов-Радушинский А.А. Роль и место иммуномодулирующей терапии в лечении инфекционно-воспалительных заболеваний, протекающих на фоне вторичной иммунной недостаточности. Медицинский совет. 2013;(11):78–81].Yarilin AA. Immunology. M.: GEOTAR-Media, 2010. (In Russ.) [Ярилин А.А. Иммунология. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010].Bruton OC. Agammaglobulinemia. Pediatrics. 1952;(9):722–726.Karzakova LM, Muchukova OM, Rasskazova NL. Primary and secondary immunodeficiency states. Zdravookhraneniye Chuvashii. 2008;(2):72–79. (In Russ.) [Карзакова Л.М., Мучукова О.М., Рассказова Н.Л. Первичные и вторичные иммунодефицитные состояния. Здравоохранение Чувашии. 2008;(2):72–79].Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E. The prokaryotes. Volume 3: Archaea. Bacteria: firmicutes, actinomycetes. New York: Springer, 2006.Steinhaus EA. A study of the bacteria associated with thirty species of insects. J Bacteriol. 1941;42(6):757–790.McNeil MM, Brown JM. The medically important aerobic actinomycetes: epidemiology and microbiology. Clinical microbiology reviews. 1994;7(3):357–417. doi: 10.1128/cmr.7.3.357Tsukamura M. Proposal of a new genus, Gordona, for slightly acid-fast organisms occurring in sputa of patients with pulmonary disease and in soil. J Gen Microbiol. 1971;68(1):15–26. doi: 10.1099/00221287-68-1-15Tsukamura M, Kawakami K. Lung infection caused by Gordona aurantiaca (Rhodococcus aurantiacus). Journal of clinical microbiology. 1982;16(4):604–607.Collins MD, Smida J, Dorsch M, Stackebrandt E. Tsukamurella gen. nov, harboring Corynebacterium paurometabolum and Rhodococcus aurantiacus. Int J Syst Bacteriol. 1988;38(4):385–391. doi: 10.1099/00207713-38-4-385Clausen C, Wallis CK. Bacteremia caused by Tsukamurella species. Clin Microbiol Newslett. 1994;16(1):6–8.Shapiro CL, Haft RF, Gantz NM, et al. Tsukamurella paurometabola: a novel pathogen causing catheter-related bacteremia in patients with cancer. Clin Infect Dis. 1992:14(1):200–203.Lai KK. A cancer patient with central venous catheter-related sepsis caused by Tsukamurella paurometabola (Gordona aurantiaca). Clin Infect Dis. 1993;17(2):285–287. doi: 10.1093/clinids/17.2.285-aShaer A, Gadegbeku C. Tsukamurella peritonitis associated with continuous ambulatory peritoneal dialysis. Clin Nephrol. 2001;56:241–246.Woo PC, Fong AH, Ngan A, et al. First report of Tsukamurella keratitis: association between T. tyrosinosolvens and T. pulmonis and ophthalmologic infections. J Clin Microbiol. 2009;47(6):1953–1956. doi: 10.1128/JCM.00424-09Lcaide ML, Espinoza L, Abbo L. Cavitary pneumonia secondary to Tsukamurella in an AIDS patient. First case and a review of the literature. J Infect. 2004;49(1):17–19. doi: 10.1016/S0163-4453(03)00139-7Chen CH, Lee CT, Chang TC. Tsukamurella tyrosinosolvens bacteremia with coinfection of Mycobacterium bovis pneumonia: case report and literature review. Springer Plus. 2016;5(1):2033. doi: 10.1186/s40064-016-3707-yYassin A, Rainey F, Burghardt J, et al. Tsukamurella tyrosinosolvens sp. nov. Int J Syst Bacteriol. 1997;47(3):607–614. doi: 10.1099/00207713-47-3-607Vazquez-Boland J. Rhodococcus equi: the many facets of a pathogenic actinomycete. Vet Microbiol. 2013;167(1–2):9–33. doi: 10.1016/j.vetmic.2013.06.016Golub B, Falk G, Spink W. Lung abscess due to Corynebacterium equi. Report of first human infection. Ann Intern Med. 1967;66(6):1174–1177. doi: 10.7326/0003-4819-66-6-1174Yamshchikov A, Schuetz A, Lyon G. Rhodococcus equi infection. Lancet Infect Dis. 2010;10(5):350–359. doi: 10.1016/S1473-3099(10)70068-2Nishi S, Valentine G, Duncan S. Emerging bacterial, fungal, and viral respiratory infections in transplantation. Infect Dis Clin North Am. 2010;24(3):541–555.Kedlaya I, Ing M, Wong S. Rhodococcus equi infections in immunocompetent hosts: case report and review. Clin Infect Dis. 2001;32(3):39–46. doi: 10.1086/318520Arlotti M, Zoboli G, Moscatelli G, et al. Rhodococcus equi infection in HIV-positive subjects: a retrospective analysis of 24 cases. Scand J Infect Dis. 1996;28(5):463–467. doi: 10.3109/00365549609037941McNeil M, Brown M. The medically important aerobic actinomycetes: epidemiology and microbiology. Clin Microbiol Rev. 1994;7(3):357–417. doi: 10.1128/cmr.7.3.357Piau C, Kerjouan M, Le Mouel M, et al. First case of disseminated infection with Nocardia cerradoensis in a human. J Clin Microbiol. 2015;53(3):1034–1037. doi: 10.1128/JCM.02979-14Flateau C, Jurado V, Lemaître N, et al. First case of cerebral abscess due to a novel nocardia species in an immunocompromised patient. J Clin Microbiol. 2013;51(2):696–700. doi: 10.1128/JCM.00762-12Al Akhrass F, Hachem R, Mohamed J, et al. Central venous catheter-associated Nocardia bacteremia in cancer patients. Emerg Infect Dis. 2011;17(9):1651–1658. doi: 10.3201/eid1709.101810Wilson JW. Nocardiosis. Updates and Clinical Overview. Mayo Clin Proc. 2012;87(4):403–407. doi: 10.1016/j.mayocp.2011.11.016Canterino J, Paniz-Mondolfi A, Brown-Elliott B, et al. Nocardia thailandica pulmonary nocardiosis in a post-solid organ transplant patient. J Clin Microbiol. 2015;53(11):3686–90. doi: 10.1128/JCM.00959-15Alavi Darazam I, Shamaei M, Mobarhan M, et al. Nocardiosis: risk factors, clinical characteristics and outcome. Iran Red Crescent Med J. 2013;15(5):436–9. doi: 10.5812/ircmj.2384Zia K, Nafees T, Faizan M, Salam O, et al. Ten year review of pulmonary nocardiosis: a series of 55 cases. Сureus. 2019;11(5):4759. doi: 10.7759/cureus.4759Hızel K, Çağglar K, Cabadak H, Külah C. Pulmonary nocardiosis in a non-Hodgkin's lymphoma patient. Infection. 2002;30:243–245. doi: 10.1007/s15010-002-2102-5Yaşar Z, Acat M, Onaran H. An unusual case of pulmonary nocardiosis in immunocompetent patient. Case Rep Pulmonol. 2014;2014:963482. doi: 10.1155/2014/963482Agterof MJ, Van der Bruggen T, Tersmette M. Nocardiosis: a case series and a mini review of clinical and microbiological features. Neth J Med. 2007,65(6):199–202.Kandi V. Human nocardia infections: a review of pulmonary nocardiosis. Cureus. 2015 15;7(8):304. doi: 10.7759/cureus.304Uhde KB, Pathak S, McCullum I Jr, et al. Antimicrobial-resistant nocardia isolates, United States, 1995-2004. Clin Infect Dis. 2010;51(12):1445–1448. doi: 10.1086/657399Arenskötter M, Bröker D, Steinbüchel A. Biology of the metabolically diverse genus Gordonia. Appl Environ Microbiol. 2004;70:3195–3204. doi: 10.1128/AEM.70.6.3195-3204.2004Shen FT, Goodfellow M, Jones AL, et al. Gordonia soli sp. nov., a novel actinomycete isolated from soil. Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(11):2597–601. doi: 10.1099/ijs.0.64492-0Richet HM, Craven PC, Brown JM, et al. A cluster of rhodococcus (gordona) bronchialis sternal-wound infections after coronary-artery bypass surgery. N Engl J Med. 1991;324:104–109. doi: 10.1056/NEJM199101103240206Sng LH, Koh TH, Toney SR, et al. Bacteremia caused by gordonia bronchialis in a patient with sequestrated lung. J Clin Microbiol. 2004;42(6):2870–2871. doi: 10.1128/JCM.42.6.2870-2871.2004Akrami K, Coletta J, Mehta S, Fierer J. Gordonia sternal wound infection treated with ceftaroline: case report and literature review. JMM Case Rep. 2017;4(9):e005113. doi: 10.1099/jmmcr.0.005113Wright SN, Gerry JS, Busowski MT, et al. Gordonia bronchialis sternal wound infection in 3 patients following open-heart surgery: intraoperative transmission from a healthcare worker. Infect Control Hosp Epidemiol. 2012;33(12):1238–1241. doi: 10.1086/668441Ambesh P, Kapoor A, Kazmi DH, et al. Sternal osteomyelitis by gordonia bronchialis in an immunocompetent patient after open heart surgery. Ann Card Anaesth. 2019;22(2):221–224. doi: 10.4103/aca.ACA_125_18